A pedra São Tomé recebe este simpático nome devido seu local de extração, já que a pedra é originária de São Tomé das Letras, cidade montanhosa localizada no sul de Minas Gerais.

Além da origem do nome, existe outras particularidades que tornam a pedra São Tomé ainda mais especial. Segundo especialistas, a pedra São Tomé pode ser considerada um quartzito, pois sua estrutura é formada a partir da recristalização de arenito que é responsável por formar grãos de quartzo.